Na początku było RNA - a może coś innego?

January Weiner

Core Unit for Bioinformatics, BIH@Charité

https://github.com/january3/sfn2023

  • 4 miliardy lat temu ustało bombardowanie Ziemi przez meteoryty
  • Najstarsze ślady życia na Ziemi pochodzą mniej więcej z tego czasu

\(\rightarrow\) Życie powstało niemal “natychmiast”

Informacja genetyczna

Maszyneria komórkowa

Jajko i kura

Świat RNA

Źródło: “Jak powstało życie na Ziemi”

Źródło: PDB

Źródło: Cech, “The ribosome is a ribozyme”, Science 2000

Życie z probówki?

Problemy ze światem RNA

Paradoks Eigena

Manfred Eigen

Manfred Eigen (1927-2019)

For optimal selection, the required precision of information transfer has to be adjusted to the amount of information to be transferred.

\(\rightarrow\) Im więcej informacji, tym mniejsza musi być częstość mutacji

COSMIC-LOPER

Capable of Surviving Modifications in Constitution

without Loss of Properties Essential for Replication

Nośnik, który:

  • poddaje się replikacji
  • jest odporny na mutacje

Jakie alternatywy?

Slide 1

To compile, type quarto render template.qmd

Make sure you have Quarto 1.2 installed from here.

Multicolumn slide

Left column title

Left column…

Right column title

Right column (60%)…

(adding .fragment causes the contents to be displayed in steps)

Part II separator slide

Simple numbered and unnumbered lists

  • One
  • Two
  1. One
  2. Two

Incremental list

  • Item 1
  • Item 2
  • Item 3

Incremental contents

First part

Second part

This is a slide without a title (use the dashes to separate)

Transitions

Define them in the YAML header or like here, in the slide title.

Types: none, fade, slide, convex, concave, zoom

Code

plot(1:10)

Figure 1: A dumb plot

Tip

Ctrl-click on the image to zoom. And here is a 3.1415927 for you.

Code

There are many customization options for the code. For example, you can highlight (and even animate) certain lines of code:

a <- rnorm(10)
b <- rnorm(10) + a
c <- a + b * rnorm(10)

You can also specify where precisely should the output of the code go: below the code (default), on the next slide, on a right-hand column…

Thank you

Acknowledgements

  • N.N.
  • Y.Y.

Sources

  • Source 1
  • Source 2

Na początku było RNA…